Строение вируса Covid-19 и белки антигенной структуры

Прежде чем научиться эффективно противостоять любой новой вирусной инфекции, необходимо узнать ее строение, ключевые структуры, механизм передачи и взаимодействия с клетками человека. Только после этого можно изобретать эффективные лекарства и вакцины.

Строение SARS-CoV-2

Коронавирус SARS-CoV-2 по своему строению отличается не только от уже привычных нам вирусов вызывающих ОРВИ и грипп, но и от своих ближайших «сородичей» — MERS и SARS-CoV-1.

Белки коронавируса

Вирус SARS-CoV-2, как и любой другой живой организм, в своей структуре имеет ряд белков, которые иммунной системой человека распознаются как чужеродные, т.е. антигены.

Основные антигены коронавируса можно разделить на 2 группы:

1. Белок «шипов» оболочки вириона — S-protein
2. Белок внутренней части (нуклеокапсида) — N-protein

Спайковый белок

Свое сокращенное название S-белок коронавируса получил от слова spike, вследствие чего его еще называют спайковый белок. Spike в переводе на русский язык означает шип. Свое название спайковый белок получил по причине своего строения — на поверхности мембраны вириона S-белки смотрятся в виде многочисленных шипов:

S-белок играет важную роль в патогенезе коронавируса, т.к. является стыковочным механизмом для контакта с клетками человеческого организма. Именно к нему вырабатываются нейтрализующие антитела при проникновении коронавируса в организм, а также после вакцинации.

Нуклеокапсидный белок

N-белок находится внутри вириона и входит в состав нуклеокапсида, т.к. является оболочкой ядра вируса. Антитела к нуклеокапсидному белку начинают вырабатываться только после разрушения вируса, т.к. от первичного контакта с иммунной системой этот белок защищен оболочкой вируса.

Эпитопы коронавируса

У каждого антигена имеются определенные «ключевые» участки — эпитопы, которые могут распознаваться иммунной системой для дальнейшего воздействия на них:

1. Эпитопы S-белка (шипов) — S1, S2, RBD
2. Эпитоп N-белка (нуклеокапсида) — N

Учитывая, что у каждого эпитопа имеется своя антигенная структура, В-лимфоцитами вырабатываются разные типы IgM и IgG:

1. anti-S1
2. anti-S2
3. anti-RBD
4. anti-N

Механизм проникновения в клетку

Как уже было сказано выше, спайковый белок играет одну из ключевых ролей в проникновении РНК коронавируса SARS-CoV-2 в клетку хозяина. Он соединяется с ACE-2 рецептором клетки хозяина, впячивается в мембрану и в виде вакуоли попадает внутрь.